PCR儀(基因擴增儀)一般有四種類型分別是普通基礎PCR儀，實時熒光定量PCR儀梯度PCR儀和原位PCR儀。這四種PCR儀的一般原理有相似的地方但在結構和配件方面還存在一些差異。

　　(1)普通基礎PCR儀由主機加熱模塊PCR管樣品基座熱蓋控制軟件組成。

　　(2)實時熒光定量PCR儀在普通PCR儀的基礎上增加一個熒光信號采集系統(tǒng)和計算機分析處理系統(tǒng)。熒光檢測系統(tǒng)主要包括激發(fā)光源和檢測器。激發(fā)光源有鹵鎢燈光源、氬離子激光器、發(fā)光二極管LED光源前者可配多色濾光鏡實現(xiàn)不同激發(fā)波長而單色發(fā)光二極管LED價格低、能耗少、壽命長不過因為是單色需要不同的LED才能更好地實現(xiàn)不同激發(fā)波長。監(jiān)測系統(tǒng)有超低溫CCD成像系統(tǒng)和PMT光電倍增管前者可以一次對多點成像后者靈敏度高但一次只能掃描一個樣品，需要通過逐個掃描實現(xiàn)多樣品檢測對于大量樣品來說需要較長的時間。

　　(3)梯度PCR儀除具有普通PCR儀的結構外還具有特殊的梯度模塊可實現(xiàn)對梯度溫度和梯度時間等參數(shù)的調整。因此可以在一次實驗中對不同樣品設置不同的退火溫度和退火時間從而可在短時間內(nèi)對PCR實驗條件進行優(yōu)化提高PCR科研效率。

　　(4)原位PCR儀與普通PCR儀相比，振動分析儀用玻片代替了PCR管其反應過程是在載玻片的平面上進行的。